Un virus sauve l’homme des bactéries résistantes aux antibiotiques
L’homme de 56 ans rejoint le nombre restreint mais croissant de patients qui ont surmonté des infections à superbactéries grâce aux bactériophages En janvier 2020, un homme de 56 ans est arrivé dans un hôpital de Boston se plaignant d’une éruption cutanée qui s’était propagée sur son bras gauche. En quelques mois, sa situation est devenue si critique qu’il a dû être hospitalisé. L’histoire de la façon dont il a surmonté cette condition est un nouvel exemple de la façon dont les virus peuvent être utilisés pour lutter contre les superbactéries résistantes aux antibiotiques,une pandémie mondiale qui tue plus que le sida, le paludisme et certains cancers chaque année .
Les bactéries résistantes aux antibiotiques s’attaquent aux personnes dont le système immunitaire est déjà affaibli par d’autres maladies ou traitements. Ces patients – des centaines de millions dans le monde – sont les plus à risque de complications graves ou même de décès dus à ces infections. L’homme qui s’est rendu au Brigham and Women’s Hospital en janvier 2020 était la victime parfaite. Il avait une maladie rénale chronique et souffrait d’arthrite dans ses articulations en raison d’un problème dans son système immunitaire qui a également causé des complications neurologiques. Les médecins ont commencé à le traiter avec des antibiotiques mais sa situation ne s’est pas améliorée. Un mois plus tard, il devait être admis. Les lésions cutanées sur son bras sont devenues si importantes que les médecins ont dû les ouvrir pour enlever les tissus morts. Aucun des antimicrobiens utilisés n’a pu vaincre les bactéries responsables de l’infection. La bactérie était Mycobacterium chelonae , un agent pathogène de la famille de la tuberculose qui peut provoquer des éruptions cutanées et des dommages étendus à d’autres organes. Le patient américain a également souffert d’effets secondaires graves dus à la toxicité de tous les antibiotiques qu’il a reçus.
Un an plus tard, l’infection s’était propagée et les abcès grossissaient et devenaient de plus en plus douloureux. À cette époque, le médecin d’origine vénézuélienne Francisco M. Marty a suggéré à ses collègues que peut-être un virus était capable de guérir le patient.
Le médecin faisait référence aux bactériophages , des virus spécialisés dans la destruction des bactéries. Pour chaque bactérie connue, il existe probablement un virus capable d’y pénétrer et de la tuer. Tout ce que les médecins avaient à faire était de trouver le bon agent pathogène. Les médecins ont extrait des microbes des plaies du patient, séquencé leur génome et recherché parmi 20 phages étudiés auparavant pour éliminer les infections par une autre superbactérie de la même famille. C’est ainsi que Muddy a été identifié, un phage qui s’est facilement débarrassé de M. chelonae en laboratoire.
Les médecins ont obtenu la permission d’utiliser Muddy comme traitement expérimental et l’ont injecté au patient par voie intraveineuse. Ils ont également poursuivi le traitement antibiotique. Les lésions se sont améliorées en seulement deux semaines. Le patient n’a eu aucun effet secondaire grave. Actuellement, il continue de recevoir un traitement viral et ne montre aucun signe d’infection, explique Jessica Little, médecin de Brigham et auteur principal de l’étude qui décrit le cas, publiée mardi dans Nature Communications “C’est la première fois que la phagothérapie est appliquée à M. chelonae “, explique Little. « De plus, c’est le premier cas dans lequel des résultats sont obtenus avec un seul virus ; normalement, des cocktails de plusieurs phages sont utilisés », ajoute-t-elle. L’homme de 56 ans rejoint le nombre restreint mais croissant de patients qui ont surmonté des infections à superbactéries grâce à cette thérapie expérimentale
C’est le premier cas dans lequel des résultats sont obtenus avec un seul virus ; normalement des cocktails de plusieurs phages sont utilisés
L’équipe médicale n’a pas identifié le patient pour préserver son intimité, mais a publié des images montrant l’évolution rapide de ses blessures après le traitement expérimental. Son cas soulève également une question importante. Le patient a développé des anticorps contre le virus Muddy, mais malgré cela, il n’y a pas eu de complications ni de rechutes, souligne Little. “Nous devons mieux comprendre l’interaction entre ces virus et le système immunitaire du patient, et si cela peut affecter le succès du traitement.”
L’étude comprend une reconnaissance à Francisco M. Marty, le médecin de Brigham qui a d’abord suggéré les phages et qui est décédé le 9 avril 2021, après être tombé d’une falaise alors qu’il prenait des photos en République dominicaine pendant ses vacances.
La chercheuse Pilar Domingo-Calap est l’une des principales expertes en Espagne sur l’utilisation des phages pour vaincre les infections récalcitrantes. Elle a récemment réussi à isoler des phages pour soigner Dani Río, un jeune de 18 ans qui était sur le point de mourir d’une infection similaire à celle du patient américain. “L’utilisation de phages pour un traitement compassionnel n’est pas nouvelle, mais le fait qu’il y ait de plus en plus de cas avec des résultats positifs renforce la nécessité de réglementer leur utilisation en milieu clinique”, dit-elle.
Pour l’instant, les bactériophages ne sont utilisés qu’en dernier recours, lorsqu’il n’y a pas d’autres options thérapeutiques. « À partir des propres souches des patients, nous recherchons les phages dans l’environnement et les caractérisons », explique Domingo-Calap. Les phages se trouvent parfois dans les endroits les moins attendus, comme les systèmes d’eaux usées des hôpitaux, qui présentent les conditions optimales pour les bactéries résistantes aux antibiotiques. L’un des objectifs actuels de la recherche est de créer une « bibliothèque » de tous les phages identifiés, organisés selon la superbactérie qu’ils peuvent tuer. Un autre objectif est de créer des cocktails de phages contre les superbactéries les plus courantes qui peuvent être largement utilisées dans la population.
Les superbactéries sont une conséquence directe de l’abus d’antibiotiques. L’utilisation aveugle pour traiter préventivement tout type d’infection ou pour engraisser le bétail a amené de nombreuses bactéries à développer une immunité contre de nombreux ou tous les antibiotiques connus. L’objectif est maintenant d’empêcher que la même chose se produise avec les phages. C’est pourquoi on recherche des virus « lytiques », qui pénètrent dans la bactérie et la détruisent littéralement. Il est important de s’assurer que les virus n’intègrent pas leur génome avec des parties de l’ADN de la bactérie. Si cela se produit, ils pourraient devenir un vecteur de transmission, ce qui nous ramènerait à la case départ dans la lutte contre cette inquiétante pandémie .
Source : Elpais
