La surveillance génomique révèle des grappes de SARM causant des infections du sang
La surveillance génomique a identifié des grappes de SARM parmi les souches cultivées à partir d’infections sanguines dans deux hôpitaux de Philadelphie, ont rapporté des chercheurs.
Le regroupement suggère “que la transmission résultait d’un mélange de propagation communautaire et d’expositions aux soins de santé bien avant” que les infections sanguines ne soient diagnostiquées, ont-ils écrit.
“Les infections nosocomiales à SARM , y compris les infections du sang, ont en fait considérablement diminué depuis 2010, mais de nombreuses personnes contractent encore des infections à SARM en dehors des hôpitaux”, a déclaré Michael Z. David, MD , PhD , professeur adjoint de médecine dans la division. des maladies infectieuses à l’Université de Pennsylvanie, a déclaré Healio.
“Nous nous demandions si nous examinions les génomes de tous les isolats de SARM de toutes les infections sanguines dans deux hôpitaux pendant un an, serions-nous capables de détecter des grappes de souches étroitement apparentées causant ces infections graves chez plus d’une personne ?” dit David.
Selon David, ils ont émis l’hypothèse qu’un événement de transmission entre patients peut se produire bien avant qu’ils ne se présentent avec des infections à SARM et que les infections peuvent ne pas se produire en même temps.
David et ses collègues ont effectué un séquençage du génome entier sur 106 isolats d’infection sanguine à SARM recueillis auprès de patients hospitalisés dans deux hôpitaux pendant 12 mois. Ils ont utilisé des dossiers médicaux électroniques pour collecter des données cliniques et des antécédents d’hospitalisation et ont évalué la similitude des infections.
Dans l’ensemble, ils ont découvert qu’il y avait neuf grappes d’isolats parmi 104 souches de SARM chez 104 patients différents dans les deux hôpitaux, ce qui signifie qu’au moins neuf souches différentes de SARM se sont propagées entre les patients des hôpitaux ou de la communauté, puis ont provoqué des infections du sang dans au moins deux personnes, dit David.
Selon David, ils ont déterminé que de nombreux patients regroupés avaient des séjours à l’hôpital qui se chevauchaient au cours de l’année précédant le diagnostic de leurs bactériémies – bien que dans d’autres cas, les patients aient été hospitalisés dans le même hôpital mais n’aient pas eu de séjours qui se chevauchaient.
David a déclaré que cela suggère que “la transmission du SARM entre les sujets de l’étude était indirecte, peut-être portée par un travailleur de la santé et transmise aux deux patients , ou peut-être colonisant un travailleur de la santé qui l’a ensuite transmis au deuxième patient”.
Il a ajouté qu’il y avait aussi des cas où les patients qui partageaient des souches de SARM groupées n’avaient pas de chevauchement hospitalier, ce qui suggère que la transmission s’est produite dans la communauté.
Les chercheurs ont également découvert que s’il n’y avait que 13 différences de polymorphisme d’un seul nucléotide parmi les souches de SARM groupées, il y avait 50% de chances que les patients aient un séjour à l’hôpital qui se chevauche au cours de l’année écoulée, a expliqué David.
“Il est probable que le SARM se propage à l’hôpital et dans la communauté, puis provoque le type d’infection le plus grave chez les personnes atteintes d’infections sanguines”, a déclaré David. “La propagation d’une personne à l’autre peut souvent se produire bien avant le début de l’infection car les gens peuvent être colonisés pendant longtemps.”
David a ajouté que parce que l’événement de transmission se produit si longtemps avant les infections dans de nombreux groupes détectés, au moment où les infections se produisent, il est «beaucoup trop tard pour empêcher la transmission» et que la détection de la transmission peut être évaluée plus efficacement lorsque les gens sont encore asymptomatiquement colonisé par le dépistage.
“Peut-être que les patients à haut risque d’infection devraient être dépistés pour la colonisation par des souches virulentes de SARM, et des preuves de propagation récente peuvent être détectées et des mesures préventives peuvent être prises”, a déclaré David.
“En résumé, les événements de transmission conduisant à des infections invasives et résistantes aux antibiotiques peuvent survenir bien avant que les infections ne soient diagnostiquées et dans la communauté”, a-t-il déclaré. “Si vous attendez que les infections se produisent, vous risquez d’être beaucoup trop tard pour empêcher les autres d’être infectés par les mêmes souches.”
Source : healio.com
